Sequence RepeatSequence Selected name Chrom Start End Duplication Duplicates SimpleRepeat SRepeatLength BLATed Blat Density Percent_GC Percent_CG Oligo_Size RepeatType RepeatClass TAAACATCCTAAGTCAACACTGTTACAAAACTCCCAAATCTATTTCTTTTTTTTAAAGTTGGCAATTACTTTTAGGTATCAAAGTAGCCGAAACTATGTGAGCAGATTTCAGTTTCGATC NA FALSE Zcchc6 chr13 59923748 59923868 FALSE 1 FALSE 0 TRUE 58.16666667 32.5 1.666666667 120 NA NA GCGGGCCCCGGGCCCCTCCCCACCAACAACTGATAGTGGCGGGCCCCAGGGTGTGTGAGTGTGTGCGTTTGGGCGTGTTGCTGGTCCAGTTCATCTCAGCTGCTGCTGCTGCAGCTGATC NA FALSE Epb4_9-Dematin chr14 71026908 71027028 FALSE 1 FALSE 0 TRUE 40.125 65 4.166666667 120 NA NA ATTTATTTATTTATTTATTTGTTTGTTTATTTATTTATTTATTGCCAGTGTGTGTGGGGTGAGGGTCCTTAGGTGGGAGACTGTCCTGTTGGTTAATAATTAGTCTCCCTAAAAGGGATC TTTATTTATTTATTTATTTGTTTGTTTATTTATTTATTTATTG FALSE NFE2 chr15 103086341 103086461 FALSE 1 TRUE 42 TRUE 232.675 34.16666667 0 120 (TTTA)n Simple GATCCTGAACTAAATAAATGAATAAAGCACTGAGTCCCATGTATGCAGTCACTGCTACCATCTTCTTACTTGATATGGAATGTAGCTAGCTGCTCCAGGCCCTGCTTCCCTGGCCTTACC NA FALSE Lmo2-1 chr2 103797392 103797512 FALSE 1 FALSE 0 TRUE 48.70833333 45.83333333 0 120 NA NA TTGCTAATCCCCAGGAGCCCCGTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAGAAAAAAAGGGGGGAGGGGGCGGGCAGCTGTCTCTTTAAATGTGATTTCCTTCTATTGTATTTGAATCGTGATC AAAAAAAAAAAAAAAAGGAAGAAAAAAAGGGGGGAGGGGGCGGGCAGCTGTCTC FALSE Lmo2-2 chr2 103810145 103810265 FALSE 1 TRUE 28 TRUE 198.3083333 40.83333333 2.5 120 (A)n Simple ACAACAGTATTCTGGGTTGTGAACTGGGGGGCGGGGGGGGGGAGACGACTTAGAACTGAGAAGATTGGTGGGGGTGGGGGTGGGGGTGGGAGAACCAACCTAGACTAAGAACCCGGGATC GTGGGGGTGGGGGTGGGGGTGGGAGAACCAACCTAGACTAAGAACCCGGGATC FALSE Tal1-2 chr4 114732333 114732453 FALSE 1 TRUE 23 TRUE 153.8083333 59.16666667 2.5 120 (TGGGGG)n Simple TTGCACCAATAACATAGCTTGTCTGTTCAATATTATCTCTTCAATATTGTTTACTACACAAATAAAAAATTAAAACACATTATACATAAGAAAATTTGCCTGTTCTGTTTTGTTTTGATC NA FALSE Hbb-b1 chr7 110962697 110962817 FALSE 1 FALSE 0 TRUE 54.71666667 25.83333333 0 120 NA NA GATCCTGCTTCAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACCAACCAATCTTAAGCCTCTGCCCTGAGCATCACTCCAGGGCGAGGAGACTCTGAGATGCCTCATCGAGTTCAG AAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACCAACCAATCTTAAGC FALSE EpoR chr9 21767534 21767654 FALSE 1 TRUE 40 TRUE 217.45 45.83333333 1.666666667 120 (CAAA)n Simple GATCCCAAGGGAGTCCTCACTGGCCTTGGCCTCTGAGTCTCCCTTCTCTCCCTCCTGCCAGCCCGCCCGCCCTCCCTCCCTCCCACTCACCTTCTCCCTCCTCTTTCCTCCCCAGGGAGT CTTCTCTCCCTCCTGCCAGCCCGCCCGCCCTCCCTCCCTCCCACTCACCTTCTCCCTCCTCTTTCCTCCCCAGGGAGT FALSE GATA1 chrX 7544949 7545069 FALSE 1 TRUE 70 TRUE 128.95 65.83333333 1.666666667 120 C-rich Low GATCCATGGTAGCACAGGGCAGCTAAGATGCAAGTCTGAAGGAGGAGTCTGGCGAGCTGCTCCTGCAGTTCCCTGGACCCAGAAGGATGAGCTAGCAGATTCACTTGAGCCAAAGGATTC NA TRUE Hba-1 chr11 32182969 32183089 TRUE 4 FALSE 0 TRUE 8.791666667 54.16666667 0.833333333 120 NA NA AAACCATGGTGCTCTCTGGGGAAGACAAAAGCAACATCAAGGCTGCCTGGGGGAAGATTGGTGGCCATGGTGCTGAATATGGAGCTGAAGCCCTGGAAAGGTGAGAACAGGACCTTGATC NA TRUE Hba-1 chr11 32183701 32183821 TRUE 2 FALSE 0 TRUE 10.7 52.5 0 120 NA NA GATCCATGGTAGCACAGGGCAGCTAAGATGCAAGTCTGAAGGAGGAGTCTGGCGAGCTGCTCCTGCAGTTCCCTGGACCCAGAAAGATGAGCTAGCAGATTCACTTGAGCCAAAGGATTC NA TRUE Hba-2 chr11 32195804 32195924 TRUE 4 FALSE 0 TRUE 9.641666667 53.33333333 0.833333333 120 NA NA AAACCATGGTGCTCTCTGGGGAAGACAAAAGCAACATCAAGGCTGCCTGGGGGAAGATTGGTGGCCATGGTGCTGAATATGGAGCTGAAGCCCTGGAAAGGTGAGAACAGGACCTTGATC NA TRUE Hba-2 chr11 32196518 32196638 TRUE 2 FALSE 0 TRUE 10.7 52.5 0 120 NA NA GATCTGTGGCTAGCTGGGGTTGGTCATCACCACCGCATGGCGGAGGCACCGGTTCAAAGTCTGTATTTTTCTCCGCTGGGGAACCTTGGGGTACCGGAGCTGGGGCCAGGTCAGGAGGGA NA TRUE TP53 chr11 69392395 69392515 FALSE 1 FALSE 0 TRUE 4.958333333 60.83333333 4.166666667 120 NA NA GCTCCGGAAATAACATGCACAAAGCACCAGGATTTAAGATTTTTCGAGATTCATAGCTTAAGACTTAAGACCCCCCATAGCATCCTAATGAAACCCTGGGTTCCGTTCCTGGATGAGATC NA TRUE TP53 chr11 69394353 69394473 FALSE 1 FALSE 0 TRUE 8.858333333 44.16666667 2.5 120 NA NA GATCAGGGAGATGCTGCTCTGGGAGGGAAGTGGAGGAGCAGAGGTAGGGACTTAGGTGTCCCTGACTGACCCTGAGCCAATCCCCTGGCTCACTCCAGGCCTGCTGCTCACCTCCTCCTC NA TRUE 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TAGGAGGTTGATGGACAGCAACAGGAAGCTGGGTGAGGAGGGGCTTAGCCGAGAAGTGTTTTTGTATTGGTCGTAATTGACCTTCCACCCACCTCTAACCCAGCAGATAAGTGATAGATC NA TRUE Sp2 chr11 96839251 96839371 FALSE 1 FALSE 0 TRUE 7.8 49.16666667 1.666666667 120 NA NA GATCCTCTGGGGCTGACGCCTCCTGGGAGGTTATGCGGAGCCGCGGCGTTCCCTGTGTGACCTTTCTCCGGGAACGCCGTGACCTCGGCGGCAAACTGCCGTCCTCCGCCCCGGCCGCCC NA TRUE ISCA1 chr13 59870727 59870847 FALSE 1 FALSE 0 TRUE 2.916666667 70.83333333 11.66666667 120 NA NA AAACTGAGCACGTACGTAGCTACCAGCCTCGCATGGAAGCACGGGCATGGTGGCTCTATCCGAGCCTCTGAGAGCGAGCGCCCTGGGCGCTACGTTAGCATCGGTTCTTGAGTCCCGATC NA TRUE ISCA1 chr13 59871483 59871603 FALSE 1 FALSE 0 TRUE 1.808333333 60 9.166666667 120 NA NA GATCTTTGTGGTTATCATTCATCCAAGCAGGCTGACTGTAAATTGGGTTTTTAAATGCATATGGATTGCTGGAAACCCCATACAGTCCTTTCCTGGGGGTGTTCCCATAGTTCCCGGGTG NA TRUE Zcchc6 chr13 59923152 59923272 TRUE 4 FALSE 0 TRUE 8.7 45.83333333 0.833333333 120 NA NA GATCGGACGGCTCAGAGCCACAGCCACCTCCGCGCACTGAGTGCTCACCACTTGTCCCCCACGACCACGACAGAGACAGAAGTGCAAGACTCCCTGGCGGAATCTAGGGGTACTCCCCCG NA TRUE Slc25A37 chr14 69902454 69902574 FALSE 1 FALSE 0 TRUE 3.1 63.33333333 6.666666667 120 NA NA GGGAGAGTCAGCAGAAGGGATATGCTCAGAGCTGCAAGAGCAGGAGAAGGGGCTGTCCCCAGAATCGGTAGTTTTGCAGACACTAATCAACCAGCTTTAGCATTCCGAAGGCTGGGGATC NA TRUE Slc25A37 chr14 69903349 69903469 FALSE 1 FALSE 0 TRUE 6.375 53.33333333 1.666666667 120 NA NA GATCTCCCTCCTGAACCCCCACCCGCTTCACCAGTCCCCTGCTGCTCTGCAAGCCACCGGCTTGGGTTCCCGGAGCTGGGGAGTCCGAGTCTGGTGTCTGGTGGGCGGGCAGGACGAGGA NA TRUE Epb4_9-Dematin chr14 71026774 71026894 FALSE 1 FALSE 0 TRUE 5.183333333 67.5 5 120 NA NA GATCTGGTGGCTCTCTTTTCTCCCATAGCATCTCAACCTCCTGCTACTAGCAGCCAAGAGTTTCCATAGAAGCATCTACACTGAGATTGAATGCCCTCCTCTTTTCAGGTCCAGCTTAGG NA TRUE NFE2 chr15 103084945 103085065 FALSE 1 FALSE 0 TRUE 8.316666667 48.33333333 0 120 NA NA GATCACCCTCTATCACTCCACACACTGAGCGGGGGCTCCTAGATAACTCATTCGTTCGTCCTTCCCCCTTTCTAAATTCTGTTTTCCCCAGCCTTAGAGAGACGCCTGGCCGCCCGGGAC NA TRUE cMyc-1 chr15 61816402 61816522 FALSE 1 FALSE 0 TRUE 6.058333333 55.83333333 5 120 NA NA 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TRUE Oct-04 chr17 35643015 35643135 TRUE 3 FALSE 0 TRUE 10.81666667 70 3.333333333 120 NA NA GATCAGCACACGCCAAGGAGATTATGAAGTAGTTGGTGACGGTTTGTAGTCGCTCGAACTTGGCAATGGCTGTGATGACCAGCACGTTGCCAAACACGATGGCCAGGACGATAACCGACA NA TRUE Adrb2 chr18 62339169 62339289 FALSE 1 FALSE 0 TRUE 2.95 51.66666667 6.666666667 120 NA NA ATACCATAACAATGGCTGACATTTAGGGCACATTCTGCTATGTGCCTTTTGTGCATTATTGCATTTAATCCTTCCCACAATTCCATGGTGGTATTTTTAGCTCGATTCTCCAATGGGATC NA TRUE Adrb2 chr18 62341282 62341402 FALSE 1 FALSE 0 TRUE 6.166666667 40 0.833333333 120 NA NA GCTCTTAAATTCAATTCTGAACAGTGCTGTGGCACCAGGCATGGCCTAATGACCCTAACCTGGGAATTCACAAAGTGAGAGCTGAGTTTGTAGTTCAATCCTGCAAAGCATGCTCTGATC NA TRUE Lmo2-1 chr2 103798312 103798432 FALSE 1 FALSE 0 TRUE 6.266666667 45.83333333 0 120 NA NA GATCATTTCTGGACTCAGTTTCAAGGAACTCAAGGCCCAGGGGGACCTAGGTTTTTCTCCTGAAAAGTAGCTAGCTGGAATCCATCTCTTCCCTTCTGTATTTCTTTCTCCTTCTAGAAC NA TRUE Lmo2-2 chr2 103809278 103809398 FALSE 1 FALSE 0 TRUE 16.75833333 45 0 120 NA NA 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NA TRUE ALAS2-2 chrX 146984377 146984497 FALSE 1 FALSE 0 TRUE 5.433333333 50 0 120 NA NA AGTGGCTGGTGCCCCAGTGGGTGGGGCAGTGCAGGGGAGGGGGTGTGCCGCCTCCTTGTGGAGGACCTTTTAGGCTCTAGTCCCTCCGCCCTTCCTGTCTATCCTGCAGGTTGTTGGATC NA TRUE GATA1 chrX 7545065 7545185 FALSE 1 FALSE 0 TRUE 8.008333333 63.33333333 1.666666667 120 NA NA